Изначально это был небольшой мавзолей, построенный над могилой основателя и главы суффийского ордена дервишей Бахоуддина Накшбанди, который умер в 1389 году и был захоронен близ селения Касри Арифон, где и располагается сегодня сама достопримечательность. В последующие века к мавзолею пристраивались всё новые и новые постройки. В результате чего, это место превратилось в большой архитектурный комплекс, где располагались: некрополь, включая мавзолеи правителей из нескольких династий (XVI – ХIХ вв.), ханака (XVI в.), две мечети (XVIII и ХIХ вв.), медресе (XVI в.) и минарет (XVIII в.).
Сегодня это место является популярным для посещения, и каждый год сюда приезжает большое количество людей, не только те, которые с почтением относятся к самой личности Накшбанди, но и просто правоверные мусульмане, так как сам мазар является святым местом.
Также в период независимости на территории комплекса был открыт музей суфизма. В его экспозиции представлены личные вещи святого, его одежда и кузнечные инструменты, книги, включая рукописные кораны, свитки с указами бухарского эмира и еще многое другое.